هر دندانپزشک قبل از انجام کارهای درمانی باید سعی کند که به وجود نقایص قلبی عروقی مادرزادی یا اکتسابی در بیمار پی ببرد چرا که در صورت عدم دقت لازم در این مورد انجام کارهای درمانی می تواند منجر به باکتریمی زود گذر ونتیجتا اندوکاردیت و اندارتریت شود. اعمال دندانپزشکی که منجر به آسیب بافت دهان و خونریزی شود می تواند باعث بروز باکتریمی گذرا گردد که معمولا 10 دقیقه یا کمتر به طول می انجامد در صورت کشیدن دندان خطر بروز باکتریمی ناپایدار به بیش از 85 درصد می رسد جراحیهای پریودنتال این خطر را به 88 % می رساند و در صورت انجام کارهای درمانی خفیف تر این درصد کاهش می یابد. در افرادی که به هر دلیلی با آنتی بیوتیک درمان می شوند عمل دندانپزشکی 9 الی 14 روز بعد از کامل شدن مصرف آنتی بیوتیک انجام می شود تا فلور طبیعی دهان دوباره ایجاد شود و از همان رژیم آموکسی سیلین برای پیشگیری استفاده شود.